| ID | 和暦 | グレゴリオ暦 | 地域 | 天変地異などの記事 | 原出典 | 掲載書誌 |
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| 00011131 | 天文9年4月9日 | 15400525 | 京都 | 洪水、小河橋小屋漂蕩、先代未聞云、 | 公卿補任 | 日本の気象史料 |
| 00011132 | 天文9年4月9日 | 15400525 | 紀伊 | 洪水汎濫、 | 高野春秋編年輯録 | 日本の気象史料 |
| 00011133 | 天文9年4月9日 | 15400525 | 京都 | 洪水、民屋漂蕩、 | 皇年代私記 | 改定史籍集覧19 |
| 00011134 | 天文9年4月9日 | 15400525 | 京都 | 洪水、民屋漂蕩、 | 皇年代略記 | 新校群書類従2 |
| 00011135 | 天文9年4月9日 | 15400525 | 京都 | 洪水、漂民屋、 | 続史愚抄中篇47 | 新訂増補国史大系 |
| 00011136 | 天文9年4月21日 | 15400606 | 京都 | 疾疫流布等ニヨリ、改元ノコトヲ幕府ニ諮ラセル、 | 大館常興日記 | 史料綜覧10-85 |
| 00011137 | 天文9年5月 | 15400615 | 世間 | 五月、六月、大雨フリ候て、世中サンサンニ候処、又八月十一日ノ暮れ程ニ、大風吹きキ候て…大海ノハタハ皆浪ニ被引、山家ハ大木ニ打被殺、堂寺宮悉ク吹キタヲシ申候、地家ノ家ハ、千ニ一、万ニ一御座候、鳥リケタ物、皆々死ニ申候、世間ノ大木ハ一本モ御座ナク候、去程ニ世ノ中ノ事申ニ不及候、殊ソイ物一向無御座候、 | 妙法寺記 | 富士吉田市史資料叢書10 |
| 00011138 | 天文9年5月12日 | 15400626 | 諸国 | 大将軍（義晴）命五岳僧侶、於内野経王堂、設大施餓鬼会…蓋茲歳、諸国往来者、餓死于道路、不遑枚挙、右京兆達上聞故也、 | 相国攷記 | 後鑑309 |
| 00011139 | 天文9年5月12日 | 15400626 | 京都 | 内野之経王堂にて、大施餓鬼、今日在之云々、諸五山僧衆被罷出て、被行之云々、 | 大館常興日記 | 後鑑309 |
| 00011140 | 天文9年5月13日 | 15400627 | 京都 | 於北野経堂、諸五山大施食、 | 長享年後畿内兵乱記 | 日本凶荒史考 |
| 00011141 | 天文9年5月14日 | 15400628 | 京都 | 夜、洛中大洪水、上京家屋多流、人民死、 | 長享年後畿内兵乱記 | 後鑑309 |
| 00011142 | 天文9年5月14日 | 15400628 | 京都 | 入夜大雨／一、今夜々中過より洪水、諸ノ家板敷をこす也、 | 大館常興日記2 | 続史料大成16 |
| 00011143 | 天文9年5月15日 | 15400629 | 京都 | 夜中、大雨、大水出、長得築地等流之云々、 | 鹿苑日録 | 日本の気象史料 |
| 00011144 | 天文9年5月15日 | 15400629 | 京都 | 夜洪水、 | 大館常興日記2 | 続史料大成16 |
| 00011145 | 天文9年5月16日 | 15400630 | 京都 | 昼時分より大雨、 | 大館常興日記2 | 続史料大成16 |
| 00011146 | 天文9年5月18日 | 15400702 | 京都 | 大雨、 | 大館常興日記2 | 続史料大成16 |
| 00011147 | 天文9年5月20日 | 15400704 | 近江 | 今朝、日行事〈摂州〉より各へ折紙在之／今度依洪水、大津海道今路已下、馬車之通路、以外損候、至東坂本御用之儀、御座候間、路次可作之由、被仰出候、然者、在々所々被成御下知、可然奉存旨、開闔申之候、可有如何候哉、各御存分一途可有御申之由、被仰出候、恐々謹言、／五月十九日 摂津守元造判／御内談衆御中 日付昨日也／如此折紙也、仍常興存分事書、委細拝見候、路次被作につきて、御下知之事、開闔言上尤無途儀、令存之由申之也、 | 大館常興日記2 | 続史料大成16 |
| 00011148 | 天文9年6月 | 15400714 | 京都 | 疫病流行のため、幕府は富商から課銭三千疋を徴収し、朝廷に祈祷料として献上、 | 公儀日記 | 人権歴史年表 |
| 00011149 | 天文9年6月 | 15400714 | 天下 | 春夏、天下大疫、人多死、 | 皇年代私記 | 改定史籍集覧19 |
| 00011150 | 天文9年6月 | 15400714 | 天下 | 春夏、天下大疫、人多死、 | 皇年代略記 | 新校群書類従2 |
| 00011151 | 天文9年6月17日 | 15400730 | 天下 | 今［ ］天下大疫、万民多［ ］於死亡、朕為民父母、徳不能覆、甚自痛焉、竊写般若心経一巻於金字…庶幾［ ］為疫病之妙薬矣、 | 後奈良天皇宸筆般若心経奥書 | 史料綜覧10-89 |
| 00011152 | 天文9年6月17日 | 15400730 | 天下 | 於禁中、不動小法、当門跡御参勤、伴僧八口、天下大疫御祈祷云々、 | 厳助往年記上 | 改定史籍集覧25 |
| 00011153 | 天文9年8月 | 15400911 | 紀伊 | 熊野…大風洪水、上綱ノ川舟流、在々浦々流人モ死ス、 | 熊野年代記 | 印影本 |
| 00011154 | 天文9年8月 | 15400911 | 甲斐 | 大雨、大風、八本杉門前門内、種樹数多吹折、僧堂諸寮舎、悉吹倒者也、 | 向嶽菴年代記 | 甲斐戦国史料叢書1 |
| 00011155 | 天文9年8月10日 | 15400920 | 京都 | 大風、同皇帝御悩、 | 長享年後畿内兵乱記 | 日本凶荒史考 |
| 00011156 | 天文9年8月11日 | 15400921 | 会津 | 夜大風吹く、古木太木ふきたをして、五こく地のそこまでかせニあい申候、 | 塔寺長帳 | 会津坂下町史Ⅱ |
| 00011157 | 天文9年8月11日 | 15400921 | 諸国 | 大風吹、比企岩殿御堂吹破、五穀不実、諸国饑饉、 | 赤城山年代記 | 赤城神社奉讃会 |
| 00011158 | 天文9年8月11日 | 15400921 | 陸奥 | 大雨、大風、 | 正法（寺）年譜住山記 | 正法寺総合調査報告書 |
| 00011159 | 天文9年8月11日 | 15400921 | 武蔵 | 大風吹、 | 年代記配合抄 | 内閣文庫 |
| 00011160 | 天文9年8月11日 | 15400921 | 京都 | 大風吹、 | 鹿苑日録 | 日本の気象史料 |