古代から鎌倉時代の末までを４チームで分担し、『大日本史料』第一編から第五編までと『正倉院文書目録』の編纂を担当しています。また部門外のプロジェクトとして、『日本荘園絵図聚影』釈文編の編纂や各種データベースの構築に参加しているスタッフもいます。
『大日本史料』は「六国史」のあとをうけて、仁和３年(887) の宇多天皇の践祚から第一編が始まり、鎌倉時代の末までをあつかう第五編までが古代史料部門に所属しています。このうち第一編と第四編は一応の編纂を終えました。第一編については引き続き別冊補遺を編纂していますが、第四編の別冊補遺は1 冊刊行したところで中絶しています。
『正倉院文書目録』は、わが国最古の古文書群である「正倉院文書」について、文字のみならず料紙の状態など様々な情報について調査してきた成果をまとめたものです。
吾妻鏡（清元定抄写）
| 第１室（第１編） | 第２室（第２編） | ||||
| 教 授 山口 英男 | 准教授 厚谷 和雄 | ||||
| □古代行政システムの在地的展開 | □古記録（日記）の校訂及び研究 | ||||
| 助 教 稲田奈津子 | 准教授 尾上 陽介（古文書古記録部より兼任） | ||||
| □古代儀礼史研究 | □平安時代官僚制の研究 □日記史料論 |
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| 第３室（第３編） | 第４室（第４編）・第５室（第５編） | ||||
| 教 授 田島 公 | 教 授 近藤 成一 |
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| □古代・中世の古典籍の伝来と 禁裏・公家文庫の研究 |
□中世における文書の機能と政治 構造との関係についての研究 |
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| 助 教 藤原 重雄 |
准教授 本郷 和人 |
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| □中世文化史・社会史 □絵画史料論 |
□中世政治史と史料論 | ||||
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